多囊肾在肾脏功能正常的情况下饮食没有特殊禁忌，如有肾功能不全的情况则需要低盐低脂优质蛋白饮食。
多囊肾不可以吃羊肉，忌食发酵性食品，菌变发酵的食品，像豆腐乳、臭鸡蛋类，食用这些食物将加速囊肿的生长速度。忌食酒精类食物，尤其是白酒，酒类对肾脏的刺激性最为严重，而且酒精类可以刺激多囊蛋白活性，加速肾肿生长，因此多囊肾病人应该戒掉。忌食巧克力，咖啡类食物。忌食高蛋白食品，各种豆类食品，比如大豆、豆腐等。高蛋白食品会在体内合成氮类代谢产物，加重肾脏的排泄力。忌食肾毒性的食物。
肾毒性食物会造成肾脏的加速损伤。忌食动物内脏类食品，尤其是肝脏，因为肝脏是动物体内最大的解毒工厂，很多动物在宰杀后代谢的毒素遗留在内脏中，如果病人吃了无疑会加重肾脏负担。
动物肉类、鸡蛋、骨髓、黑芝麻、樱桃、桑椹、山药等含铁丰富的水果蔬菜;有利尿作用的食品;能容石化石的蔬菜食品;碱性食物亦多服用，能起到治疗辅助作用。