蛋白质分子大小：肾小球毛细血管壁的三层结构对血浆蛋白有机械屏障作用，蛋白质分子量越大，滤过越少或完全不能滤过；
蛋白质带电情况：正常肾小球滤过膜带负电荷，构成了静电屏障，基于同性电荷相斥的原理，带负电荷蛋白质滤过率最低，而带正电荷者滤过率最高。
肾小球疾病时，使肾小球滤过膜带负电荷的成分明显减少，使带负电荷的白蛋白易于滤过而形成蛋白尿；蛋白质的形状和可变性也可影响尿蛋白的滤过；血液动力学改变，比如血压升高，可以使血流动力学发生变化，而导致蛋白尿的产生。
同时，一些其他细胞因子也可以引发蛋白尿，肾小球滤过膜的结构变化，比如足细胞的结构和形态改变，也是引起蛋白尿的重要原因。