16岁的孩子会肾囊肿，可能是由于先天性因素、遗传性因素、感染性因素、药物性因素、肾结石因素等原因所引起的。
1、先天性因素
如果孩子在胚胎时期，肾脏发育异常，就可能会导致肾脏出现囊性病变，从而引起肾囊肿。如果孩子没有出现明显的不适症状，一般不需要进行特殊治疗，但要定期到医院复查。
2、遗传性因素
如果父母双方或一方患有肾囊肿，可能会导致孩子出现遗传性肾囊肿，通常表现为肾脏出现单发或多发的囊肿。如果肾囊肿体积较小，没有引起不适症状，通常不需要进行特殊治疗，但如果肾囊肿体积较大，导致孩子出现腰痛、腹部肿块等症状，则需要及时在医生指导下通过手术进行治疗。
3、感染性因素
如果孩子受到细菌、病毒等感染，可能会导致肾脏出现炎症反应，从而引起肾囊肿。建议孩子在医生指导下使用头孢克肟胶囊、阿莫西林胶囊等药物进行抗感染治疗。
4、药物性因素
如果孩子长时间服用对肾脏有损伤的药物，如非甾体抗炎药、氨基糖苷类抗生素等，可能会导致肾脏出现损伤，从而引起肾囊肿。建议孩子及时停止服用对肾脏有损伤的药物，必要时也可遵医嘱更换其他药物进行治疗。
5、肾结石因素
如果孩子平时饮水较少，或者经常食用含草酸、钙含量较高的食物，可能会导致肾脏出现结石，从而诱发肾囊肿。建议孩子在医生指导下使用排石颗粒、复方金钱草颗粒等药物进行治疗。必要时，还可遵医嘱通过体外冲击波碎石术进行治疗。
建议患者及时就医，明确具体病因后进行对症治疗。