肾结石对肾的影响主要取决于结石的大小和位置。
如果结石存在于输尿管，则会导致同侧输尿管及泌尿系统梗阻，长时间的泌尿系统梗阻会加重肾脏积水，影响肾功能，严重时可能导致无功能肾的发生，最终因为一颗小的结石而不得不切除肾脏。
如果结石存在于肾脏，则需要观察其大小及位置是否存在于肾盏的出入口。如果在肾盂输尿管交界处或者肾脏的出入口，那么会造成肾脏积水，影响肾功能；如果本身结石体积较小或仅存在于肾脏下盏内，没有堵住各个肾盏的出入口，则对肾功能的影响不大。
建议发现泌尿系结石后，一定要行相关的检查，比如泌尿系彩超或泌尿系 CT 平扫、肾功能等，观察泌尿系结石的大小、位置，以及肾功能情况，以确定是否需要进一步治疗。必要时，可能需要行肾图等进一步检查，观测双肾分肾功能情况。
每年都会有因为泌尿系结石导致病人出现严重的肾功能损坏，从而切除肾脏的病例，也就是说泌尿系结石是可能会诱发一些严重后果的，那么泌尿系结石都有哪些危害呢？
首先，很多病人会出现明显的症状，比如说腰痛，也有些病人表现得并不明显，仅仅是腰部的酸胀不适等。
还有些病人呢会出现比较明显的肉眼血尿。我们更关注的是泌尿系结石对肾脏的影响，如果病人的结石造成了泌尿系的梗阻，就会出现明显的肾积水，如果肾积水持续的时间很长，就会造成肾功能不可逆的一种损害，泌尿系结石是可能会导致病人出现肾功能衰竭的。
另外有些病人，因为结石的梗阻会造成泌尿系严重的感染，甚至出现发热以及感染中毒的休克的表现，这种情况的出现是非常严重的，可以导致病人死亡。