肾病综合征有四大并发症：
一、感染。最常见的感染部位是呼吸道感染、泌尿道感染、皮肤感染，感染是肾病综合征中最常见的并发症，患者因为长期营养不良，免疫功能紊乱，且应用糖皮质激素等，均与抵抗力降低有关。
二、血栓栓塞并发症，最常见的发生部位是肾血栓，与高脂血症、血液黏稠有关。一旦发生血栓，要及时抗凝治疗，因为血栓和栓塞是影响肾病综合症治疗和预后的重要原因。
三、急性肾功能衰竭，只有一小部分患者可能会出现急性肾衰竭，尤其是微小病变性肾病最多见。
四、蛋白质及脂肪代谢紊乱，高脂血症增加了血液黏稠度，促进血栓栓塞并发症的发生，还可以增加心脑血管系统的并发症，并可促进肾小球硬化和肾小管间质的病变，促进肾脏病变的慢性进展。
急性肾衰竭
急性肾衰竭是肾病综合征最严重的并发症。肾病综合征患者因大量蛋白尿、低蛋白血症、高脂血症，体内常处在低血容量及高凝状态，故当急性失血、呕吐、腹泻所致体液丢失，外科损伤、腹水，大量利尿及使用抗高血压药物后，都会使肾灌注骤然减少，进而使肾小球滤过率降低，并因急性缺血后小管上皮细胞肿胀、变性及坏死，导致急性肾功能衰竭的发生。此外，肾间质水肿、蛋白浓缩形成管型堵塞肾小管等因素，也可诱发急性肾功能衰竭。
感染
由于大量免疫球蛋白从尿中丢失，血浆蛋白降低，影响抗体形成。肾上腺皮质激素及细胞毒药物的应用，使病人全身抵抗力下降，极易发生感染，如皮肤感染、原发性腹膜炎、呼吸道感染、泌尿系统感染，甚至诱发败血症。
冠心病
肾病综合征患者常有高脂血症及血液高凝状态，因此容易发生冠心病。有调查报告显示：肾病综合征患者的心肌梗塞发生率比正常人高8倍。冠心病已成为肾病综合征死亡原因的第三因素（仅次于肾功能衰竭和感染）。
血栓形成
肾病综合征患者容易发生血栓，发生率可达25%～40%。形成血栓的原因有水肿、病人活动少、静脉淤滞、高血脂、血液浓缩使粘滞度增加、纤维蛋白原含量过高及使用肾上腺皮质激素而血液易发生高凝状态等。
电解质及代谢紊乱
反复使用利尿剂或长期不合理地禁盐，都可使肾病综合征患者继发低钠血症；使用肾上腺皮质激素及大量利尿剂导致大量排尿，若不及时补钾，容易出现低钾血症。