总的说来，是医生通过验血、验尿做B超等检查还不能对肾脏病进行确诊，或者虽然临床确诊了但还不清楚肾脏损害的严重程度，而这种对病情的清晰了解决定着医生是否会实施特殊的诊疗方案，这个方案的实施与否又直接影响到该病的预后。
这时，医生就会建议患者做肾穿刺（病理检查），目的是获得肾脏病的病理诊断，从而指导医生评估目前病情、制定最合适的治疗方案，以及预测远期的可能结局（预后）。
一般公认，以下情况是肾穿刺的适应证：
1.急性肾炎原因不清、治疗效果又不好的；
2.长期有蛋白尿、血尿及发作性肉眼血尿，原因不明的；
3.难治性肾病综合征（激素耐药、激素依赖及频繁复发）；
4.过敏性紫癜肾炎、狼疮性肾炎：病情严重及治疗效果不好的。