肾囊肿的诊断主要根据有家族史，中年人有腰腹疼痛或绞痛，伴血尿，或原因不明的肾功能衰竭而贫血相对不明显。检查肾脏明显肿大者。腹部X片可见肾脏不规则增大的轮廓。静脉肾孟造影显示肾孟被拉长，肾盏变平或呈半月状。超声波检查可发现积液的囊腔并了解其体积之大小。
几种治疗肾囊肿的方法
现代医学对本病缺乏有效的治疗方法，主要是积极处理并发症（尿路感染、结石、梗阻者），避免尿路刨伤性检查。近年来有人报道对孤立性大囊腔可注射无水酒精作封闭疗法。对晚期病例引起的尿毒症有时作肾移植，或慢性透析。
本病在中医学中可属“症积”、“痞块”、“腹痛”、“尿白”和“肝阳”等范畴。《灵枢·本脏第四十七》有“肾大则善病腰痛不可俯仰，易伤于邪”之说。先天禀赋不足，肾气衰微，作强失职，恶血内阻，渐成囊状，病延日久，肾气衰于下，肝阳亢于上，湿浊停于中焦，尿少泛恶，浮肿头痛诸症丛生，终至危境而告终。
中医食疗大多注重扶正固本，理气活血，标本兼顾。中医食疗方法大多见效比较慢，但是效果稳定，副作用少，不宜复发。现在治疗肾囊肿多以该方法为主。
1、手术切除：
采取手术方法，切除囊肿壁的肾外部分并引流。这种治疗方法被证实疗效颇佳。但是这个治疗方法适用于，保守治疗后无效果的患者，而且需要根据患者自身的情况，来决定是否能采取手术治疗。它的优点是治疗彻底，但损伤大，恢复慢且费用较高。
2、穿刺疗法：
对于4cm大小的肾囊肿患者，可实行穿针刺疗法，从皮肤刺入囊肿，吸出囊液，暂时性减轻疼痛。这么做虽然避免了开刀之苦，但穿刺后病情易反复发作，对患者造成了极大的损害。而且腰部会遗留较长的手术疤痕，囊肿在手术半年后还会继续增大。肾穿刺优点是治疗简单，不用太痛苦且费用较低，任何部位的囊肿除肾盂旁囊肿外，都可治疗，缺点就是易复发。
3、西医疗法：
西医治疗方法见效快优势突出，但具有一定的副作用伤害，一般不建议患者，长期使用西医治疗方法。
4、中医食疗：
中医食疗大多注重扶正固本，理气活血，标本兼顾。中医食疗方法大多见效比较慢，但是效果稳定，副作用少，不宜复发。现在治疗肾囊肿多以该方法为主。比如吃点药用真菌“瑞芝堂蛹虫草”，其性温和而无毒、无火，能改善肝、肾、肺等脏器的细胞动力学状态和总体代谢，有利于体内有毒废物或其它药物残毒的排除。