如果是孤立性囊肿，一般不需要治疗，只要观察其发展，有很多会自行钙化吸收，一旦发现有发展趋势，应立即就诊。如果是多发性囊肿，就应该引起警惕，必须找对治疗肾脏囊性疾病的医院和疗法，进行正确有效的治疗。
治疗肾脏囊性疾病的方法是：
一、保肾排毒。口服和静脉滴注药物往往使病情加重，而“循经护肾治疗仪”从经络给药，利用远红外和永磁的共同作用，将中药有效成分送到督脉和足太阳膀胱经，再通过电磁波刺激任脉等经络，打通经络，沟通机体表里上下内外，使体内毒素及邪气从呼吸道、皮肤及肠道排出体外，肾脏的淤阻中毒状态立即得到改善。
二、排出囊内积液。使用循经护肾治疗仪，通过经络循环将活血化瘀，疏通经络的药物有效成分输送到肾脏及囊壁内，增加囊壁的通透性，加速血液循环，促使囊内液排出。然后将附着在囊壁上的免疫复合物清理干净，再用祛瘀生新、滋阴清热、调补肝肾、健脾益气的手段全面修复肾细胞，逐步恢复肾脏功能。
这种排出积水的方法较之于手术不易复发，患者痛苦少，费用也少得多。